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CCL13/MCP-4 技术参数全览:从序列到功能的硬核拆解
发表时间:2025-09-161. 基因与蛋白基础参数
- 官方符号:CCL13(Human Gene Nomenclature Committee 编号 HGNC:10608)
- 染色体定位:17q12,与 CCL2、CCL7、CCL11 形成 350 kb 的趋化因子基因簇
- 转录本长度:NM_005408.4,1 904 bp,含 3 个外显子
- 编码区:297 bp,翻译 98 个氨基酸
- 信号肽:1–23 aa,剪切后分泌型成熟肽 75 aa
- 分子量: recombinant mature CCL13 理论 8.6 kDa,SDS-PAGE 表观 10–11 kDa(糖基化导致)
- 等电点:pI 9.8,碱性蛋白,与肝素高亲和力结合
2. 三维结构参数
- 折叠类型:CC 趋化因子特征性“三指”结构
- PDB 条目:2RA4(NMR,pH 6.0,25 °C)
- 二硫键:Cys33–Cys75、Cys34–Cys58,锁定 N-loop 与 β3 链,缺失任一桥活性下降 >90 %
- 受体结合面:N-loop 的 Arg18–Lys19–His21 阳性补丁与 CCR2 的 ECL2 酸性残基形成盐桥
3. 受体与信号通路参数
- 主要受体:CCR2(Kd 2.3 nM),CCR3(Kd 18 nM)
- G 蛋白偶联:Gαi1/2,Gβγ 介导 PI3Kγ 与 PLCβ 双通路
- 第二信使:IP3 峰值 30 s,胞内 Ca2+ 最大升幅 400 nM(FLIPR 检测)
- β-arrestin 招募:EC50 4.7 nM(NanoBiT assay)
4. 表达调控参数
- 启动子区:?1 200 bp 含 2 个 NF-κB、1 个 C/EBPβ 位点
- 诱导剂:IL-1β 10 ng/mL 刺激 6 h,mRNA 上调 180 倍;TNF-α 单独仅 25 倍
- 表观修饰:H3K27ac 在 ?240 bp 增强子区富集 6.8 倍(ChIP-seq,GM-CSF 诱导的嗜酸粒细胞)
5. 体外功能参数
- 趋化活性:对 CD14+ 单核细胞 EC50 0.8 nM(Transwell 5 μm 孔径,3 h)
- 脱敏窗口:连续暴露 30 min,CCR2 内化率 72 %,恢复半衰期 90 min
- 协同效应:与 CXCL10 联用,迁移指数提高至 2.4 倍,单用无叠加
6. 体内半衰期与清除
- 小鼠血浆 t1/2:3.2 min(尾静脉 5 μg 推注),肾小管刷状缘 megalin 介导摄取
- 人玻璃体 t1/2:8.7 h(眼内炎症模型),因透明质酸黏滞度升高降低肾滤过
7. 检测技术参数
- ELISA 灵敏度:0.7 pg/mL(R&D DuoSet),线性范围 3–300 pg/mL
- Luminex 交叉反应:与 CCL2 共享抗体 4.2 %,需加 50× 冷 CCL2 封闭
- 单细胞 qPCR 效率:探针跨越外显子 2–3,扩增子 87 bp,效率 98 %,检测限 3 拷贝
8. 重组蛋白工艺参数
- 表达系统:E. coli BL21(DE3) 包涵体,复性条件 0.5 M L-精氨酸 + 1 mM GSH/GSSG,4 °C 24 h
- 内毒素水平:<0.05 EU/μg(LAL 法),符合 FDA 细胞治疗用辅料标准
- 冻干保护剂:5 % 海藻糖 + 0.01 % Tween-80,25 °C 加速 4 周,聚集率 <2 %
9. 动物模型剂量换算
- 小鼠哮喘模型:气道滴注 2 μg/50 μL,24 h 后 BALF 嗜酸粒细胞升高 5.3 倍
- 人源化小鼠:按 1 μg/kg 皮下植入 Alzet 1007D,稳态血药 150 pg/mL,模拟中度哮喘患者水平
10. 质量控制金标准
- N端测序:前 15 aa 必须与 UniProt Q99616 一致,任何截短即判为不合格
- 生物活性批次差异:EC50 CV 必须 <10 %,以 CD14+ 单核细胞迁移为放行指标
- 宿主蛋白残留:<10 ppm(ELISA 夹心法),高于此阈值触发回顾性验证